Для Linux есть формат приложений AppImage. У него есть свои поклонники, которые предпочитают привычные программы именно в таком формате, поскольку они не засоряют систему и не оставляют файлы в разных ее частях.
Если проводить аналогию с Windows, то AppImage является аналогом Portable программ. Все файлы находятся в одной папке (за редким исключением), они легко переносятся между системами и не оставляют следов. Только у данного формата есть и свои проблемы, например, они не обновляются также легко, как программы установленные через пакетный менеджер.
Последнюю проблему я для себя решил с помощью утилиты Gear Lever. С ее помощью можно добавить в единый интерфейс все свои программы в Gear Lever. Также можно быстро проверить наличие обновлений, обновить их и другие приятные особенности. Например, можно быстро перенести все AppImage в одну папку, если они у вас находятся в разных.